Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2cQ69ZS6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sv2cQ69ZS6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sv2cQ69ZS6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sv2cQ69ZS6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sv2cQ69ZS6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sv2cQ69ZS6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sv2cQ69ZS6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2cQ69ZS6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms