Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms