Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eepd1Q3TGW2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eepd1Q3TGW2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eepd1Q3TGW2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eepd1Q3TGW2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eepd1Q3TGW2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eepd1Q3TGW2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms