Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms