Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Apoc2Q05020 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Apoc2Q05020 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Apoc2Q05020 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Apoc2Q05020 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Apoc2Q05020 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Apoc2Q05020 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms