Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GscQ02591 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GscQ02591 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GscQ02591 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms