Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp3P63024 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms