Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

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Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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