Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA4P35212 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA4P35212 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms