Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Saa4P31532 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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