Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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