Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms