Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms