Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sp100O35892 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Sp100O35892 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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