Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaxO35602 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RaxO35602 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RaxO35602 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms