Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Fam240aJ3QNP9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms