Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms