Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms