Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms