Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms