Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms