Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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