Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vmn2r25W4VSP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms