Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer3W4VSP1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer3W4VSP1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms