Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vstm4T1NXB5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vstm4T1NXB5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms