Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lgr5Q9Z1P4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lgr5Q9Z1P4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms