Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog1Q9Z160 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog1Q9Z160 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog1Q9Z160 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog1Q9Z160 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms