Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4fQ9Z123 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4fQ9Z123 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4fQ9Z123 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms