Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1a4Q9WV27 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a4Q9WV27 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms