Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul1Q9WTX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul1Q9WTX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms