Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skp1Q9WTX5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms