Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NbnQ9R207 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NbnQ9R207 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms