Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab1Q9R078 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkab1Q9R078 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms