Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf25Q9QZR0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf25Q9QZR0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms