Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Exo1Q9QZ11 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Exo1Q9QZ11 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Exo1Q9QZ11 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms