Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2e3Q9QXZ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms