Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mkrn1Q9QXP6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn1Q9QXP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn1Q9QXP6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn1Q9QXP6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms