Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cabp1Q9JLK7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cabp1Q9JLK7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cabp1Q9JLK7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cabp1Q9JLK7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms