Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn15Q9JLG8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn15Q9JLG8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn15Q9JLG8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn15Q9JLG8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms