Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2l2Q9JLG4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms