Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin3Q9JLB9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nectin3Q9JLB9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms