Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp4Q9JKV5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms