Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf3Q9JKL4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf3Q9JKL4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms