Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Alyref2Q9JJW6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alyref2Q9JJW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms