Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1fQ9JIS7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1fQ9JIS7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms