Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tulp4Q9JIL5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tulp4Q9JIL5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tulp4Q9JIL5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tulp4Q9JIL5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms