Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp29Q9ES63 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp29Q9ES63 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp29Q9ES63 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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