Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dap3Q9ER88 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dap3Q9ER88 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms