Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf23Q9ER63 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms