Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms